Генетические исследования двух древних ДНК привели к новым данным о вирусах
Генетические исследования ДНК двух древних образцов — останков сибиряка, жившего около 45 тысяч лет назад, и ледяной мумии Этци, обнаруженной в Альпах и датированной 5300–5100 годами до н. э., — предоставили новые данные о распространении вирусных инфекций в древности. Результаты, опубликованные на платформе bioRxiv.org, продемонстрировали наличие вируса папилломы человека (ВПЧ) 16 типа, подтипов A1 и A4, в обоих образцах, что свидетельствует о длительной циркуляции этого высокоонкогенного вируса в популяциях человека.
До недавнего времени диагностика заболеваний древних людей основывалась на анализе патологических изменений костей, что было весьма затруднительно. Современные методы молекулярной генетики позволяют выявлять инфекции, не оставляющие видимых следов на костях, такие как чума. Первые случаи чумы, датируемые 5-м тысячелетием до н. э., были обнаружены в Сибири, Прибалтике, Скандинавии и Центральной Европе, что подчеркивает глобальный характер распространения этого заболевания.
Анализ древней ДНК открывает новые возможности для идентификации возбудителей различных инфекционных заболеваний, включая проказу, возвратный тиф, гепатит и сальмонеллёз. Марсело Брионес с коллегами из Университета Сан-Паулу провели исследование, направленное на изучение папилломавирусов, ассоциированных с развитием рака. В рамках этого исследования была проверена сохранность ДНК вируса папилломы человека в тканях двух древних индивидов.
Объектами исследования стали ледяная мумия Этци и Усть-Ишимский человек, обнаруженный в 2008 году в районе села Усть-Ишим Омской области. Усть-Ишимский человек является одним из древнейших представителей современных людей в Евразии и обладает геномом, относящимся к числу самых ранних среди сапиенсов, наряду с находками из Златы Кунь и Ильзенхёле.
Генетические анализы выявили присутствие ВПЧ 16 типа в обоих образцах. Этот вирус обладает высоким онкогенным потенциалом и является основной причиной развития рака шейки матки. В случае Этци был обнаружен подтип A1 европейского происхождения, в то время как у Усть-Ишимского человека выявлен подтип A4 европейско-азиатского происхождения, что указывает на разнообразие генетических линий вируса в древних популяциях.
Присутствие ВПЧ 16 в образцах, относящихся к разным регионам и эпохам, свидетельствует о длительной циркуляции этого вируса среди предков человека. Ранее предполагалось, что вирус мог быть передан современным людям через неандертальцев, однако новые данные указывают на возможность его существования у предков человека гораздо раньше. Несмотря на наличие неандертальских генов у обоих индивидов, результаты исследования подтверждают, что ВПЧ 16 представляет собой древнюю вирусную линию, распространявшуюся среди популяций задолго до взаимодействия с неандертальцами.
Генетический анализ также позволяет выявлять другие инфекции. Например, в останках, датируемых 2000 годом до н. э., обнаруженных в ЮАР, была выявлена ДНК риккетсии кошачьей. На Южном Урале в останках древних людей была обнаружена ДНК вируса герпеса первого типа, что демонстрирует широкий спектр инфекционных агентов, циркулировавших среди предков человека.